Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc43Q3V0L5 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms