Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms