Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pfdn4Q3UWL8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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