Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap1Q3UUV5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms