Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28047Q3US59 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms