Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec31aQ3UPL0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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