Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx27Q3UHD6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx27Q3UHD6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms