Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pid1Q3UBG2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms