Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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