Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Q3U6N9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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