Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf149Q3U2C5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rnf149Q3U2C5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf149Q3U2C5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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