Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tatdn3Q3U1C6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tatdn3Q3U1C6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms