Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp13a5Q3TYU2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp13a5Q3TYU2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms