Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccndbp1Q3TVC7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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