Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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