Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samd11Q1RNF8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Samd11Q1RNF8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms