Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam171bQ14CH0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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