Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp2b3Q0VF55 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b3Q0VF55 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms