Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttc21bQ0HA38 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ttc21bQ0HA38 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms