Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
MitfQ08874 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms