Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pou6f1Q07916 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms