Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Col9a2Q07643 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms