Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdx4Q07424 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cdx4Q07424 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms