Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sh3bp2Q06649 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sh3bp2Q06649 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms