Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fmn1Q05860 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms