Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sox12Q04890 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sox12Q04890 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms