Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpd1Q04519 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpd1Q04519 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms