Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scg2Q03517 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scg2Q03517 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms