Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NfiaQ02780 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms