Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd1Q01822 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms