Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grin2cQ01098 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms