Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Serpina1cQ00896 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms