Protein–RNA interactions for Protein: P97817

Cdr2, Cerebellar degeneration-related protein 2, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2P97817 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cdr2P97817 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cdr2P97817 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdr2P97817 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdr2P97817 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cdr2P97817 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdr2P97817 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdr2P97817 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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