Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Bop1P97452 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Bop1P97452 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Bop1P97452 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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