Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim43bP86448 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim43bP86448 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms