Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx1P83917 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx1P83917 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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