Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ptprn2P80560 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ptprn2P80560 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptprn2P80560 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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