Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pitx1P70314 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms