Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sumo1P63166 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sumo1P63166 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms