Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crabp1P62965 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crabp1P62965 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms