Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl23P62830 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms