Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl18aP62717 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpl18aP62717 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms