Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pou3f4P62515 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pou3f4P62515 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms