Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snap25P60879 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snap25P60879 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms