Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ppfia3P60469 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ppfia3P60469 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms