Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scarf2P59222 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scarf2P59222 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms