Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ripk2P58801 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms