Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gp1bbP56400 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms