Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rrp1P56183 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp1P56183 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp1P56183 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp1P56183 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp1P56183 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rrp1P56183 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms