Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NcanP55066 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NcanP55066 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NcanP55066 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcanP55066 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NcanP55066 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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